方云
博士，特聘教授，硕士生导师。2015年6月博士毕业于中南大学资源加工与生物工程学院，获微生物学博士学位（导师：邱冠周院士、刘学端教授、许玫英研究员）。先后在广东省科学院广东省微生物研究所、中国地质大学（武汉）、美国迈阿密大学进行博士后研究。2021年9月入职武汉工程大学，入选湖北省有关人才计划（2021），武汉工程大学第四层次人才（2021）。近年来主要从事污染物微生物降解转化与资源开发、极端环境微生物领域的研究，现已主持国家自然科学基金面上项目、国家自然科学基金青年科学基金项目、中国博士后科学基金面上项目，并作为骨干参与国家自然科学基金重大研究计划重点项目、国家自然科学基金面上项目、广东省省级科技计划项目等，取得了多项具有国际水平、创新性的研究成果。在mBio、The ISME Journal、Applied and Environmental Microbiology 、Environmental Science& Technology等国际期刊发表论文14篇（第一/共一9篇，封面论文1篇），申请授权国家专利4项。获广州市科学技术进步奖1项。现担任Soil Ecology Letters、Frontiers in Microbiology、Frontiers of Environmental Science & Engineering等国际期刊的审稿专家。
联系方式
fangy@wit.edu.cn; fangyun1987@126.com;
专业领域
应用微生物；环境微生物；生物技术与工程；生物化工；发酵工程；
教育工作经历
2005/09-2009/06 中南大学资源加工与生物工程学院，生物工程，学士；
2009/09-2015/06 中南大学资源加工与生物工程学院，微生物学，博士；
2011/09-2015/06 广东省微生物研究所，华南应用微生物国家重点实验室，联合培养；
2015/10-2017/11 广东省微生物研究所，华南应用微生物国家重点实验室，博士后；
2018/03-2021/08 中国地质大学（武汉），生物地质与环境地质国家重点实验室，博士后/助理研究员；
2018/04-2019/11 美国迈阿密大学（牛津），地质与环境地球科学系，交流访问；
2021/09-至今 武汉工程大学，环境生态与生物工程学院，特聘教授。
奖励与荣誉
2017 年广州市科学技术进步奖（14/15）；
2016 年 广东省微生物研究所 优秀研究生奖励；
2016 年 中国微生物学会学术年会 优秀学术 poster 奖励；
2016 年 全国环境微生物学年会 简浩然优秀论文奖励；
2014 年 广东省遗传学会第九届代表大会暨学术研讨会 优秀学术论文奖励；
2009 年 中南大学 学士学位论文获校优秀论文奖励；
2008 年 中南大学 校级蒋维英大学生奖学金；
代表性科研项目
2021-2024 国家自然科学基金面上项目, 矿山酸性废水底泥中参与铁硫循环的古菌群落组成与功能的季节性演变, 42077281, 在研, 主持
2017-2019 国家自然科学基金青年科学基金项目, 基于功能活性可视化追踪的芳烃降解微生物高通量筛选方法, 31600077, 结题, 主持
2017中国博士后科学基金面上项目，芳烃污染物降解中丝状希瓦氏菌形成及调控机理，2017M612622，结题，主持
2019-2022 国家自然科学基金重大研究计划, 金属还原地杆细菌到巴氏甲烷八叠球古菌种间电子直接传导的分子机理，91851211, 在研, 参与
2020-2023 国家自然科学基金重大研究计划, 滇藏热泉微生物介导的碳氮循环及其环境适应机制, 91951205，在研, 参与
2022-2025 国家自然科学基金委面上项目,热泉微生物介导的硫化物矿物膜的形成机制及其地质学意义, 42172339，在研, 参与
2020-2023 国家自然科学基金面上项目, 青藏高原湖泊微生物激发效应对沉积物有机碳矿化的影响及其对盐度的响应, 41972317, 在研, 参与
2019-2022 国家自然科学基金面上项目, 热泉嗜热硫酸盐还原菌对有机碳矿化的过程和机理研究—以西藏热泉为例, 41877322, 在研, 参与
2018-2021 国家自然科学基金面上项目, 典型污染区域河流底泥中氯代有机磷阻燃剂的厌氧微生物降解, 41773132, 结题, 参与
2016-2017广东省省级科技计划项目，广东省环境保护微生物与生态安全创新科研团队建设，2016B070701017,结题, 参与
代表性学术论文
(1)Yun Fang，Yang Yuan, Jun Liu, Geng Wu, Jian Yang, Zhengshuang Hua, Jibin Han, Xiying Zhang, Wenjun Li, Hongchen Jiang. Casting Light on the Adaptation Mechanisms and Evolutionary History of the Widespread Sumerlaeota.mBio. 2021, 12(2): e00350-21.
(2)ShaTan, Jun Liu,YunFang(co-first author)，Brian Hedlund, Zhenghan Lian, Liying Huang, Jin-tian Li, Linan Huang, Wen-Jun Li, Hongchen Jiang, Hailiang Dong, Wen-sheng Shu. Insights into ecological role of a new deltaproteobacterial orderCandidatusAcidulodesulfobacterales by metagenomics and metatranscriptomics.The ISME Journal. 2019, 13, 2044-2057.
(3)YunFang, Jun Liu, Guannan Kong, Xueduan Liu, Yonggang Yang, Enze Li, Xingjuan Chen, Da Song, Xuejiao You, Guoping Sun, Jun Guo, Meiying Xu. Adaptive Responses ofShewanella decolorationisto Toxic Organic Extracellular Electron Acceptor Azo Dyes in Anaerobic Respiration.Applied and Environmental Microbiology.2019, 85(16): e00550-19.
(4)YunFang, Xingjuan Chen, Yin Zhong, Yonggang Yang, Fei Liu, Jun Guo, Meiying Xu. Molecular mechanism of zero valent iron-enhanced microbial azo reduction.Environmental Pollution. 2021, 290: 0-118046.
(5)Yun Fang, Chunjie Zhu, Xingjuan Chen, Guoping Sun, Meiying Xu, Guoping Sun, Jun Guo, Yan Wang, Jinnon Yoo, Cuijuan Tie, Xin Jiang, Xianqiang Li. Copy number of ArsR reporter plasmid determines its arsenite response and metal specificity.Applied Microbiology and Biotechnology. 2018, 102(13): 5753-5761.
(6)Yun Fang, Meiying Xu, Wei-Min Wu, Chen Xingjuan, Sun Guoping, GuoJun, Liu Xueduan. Characterization of the enhancement of zero valent iron on microbial azo reduction.BMC Microbiology. 2015, 15:85-93.
(7)Yun Fang, Meiying Xu, Xingjuan Chen, Guoping Sun, Jun Guo, Wen-Min Wu, Xueduan Liu. Modified pretreatment method for total microbial DNA extraction from contaminated river sediment.Frontiers of Environmental Science & Engineering. 2015, 9, 444–452.
(8) Meiying Xu,Yun Fang(co-first author), Jun Liu, Xingjuan Chen, Guoping Sun, Zhengshang Hua, Qichao Tu, Wu Liyou, Jizhong Zhou, Xueduan Liu. Draft genome sequence ofShewanella decolorationisstrain S12, a dye-degrading bacterium isolated from a wastewater treatment plant.Genome Announcements. 2013. 1:e00993-00913.
(9) Zhijun Zhou,Yun Fang(co-first author), Qihou Li, Yili Liang, Qian Li, Nuo Li, Xinxing Liu, Guangzhou Qiu, Xueduan Liu. Global transcriptional analysis of stress-response strategies inAcidithiobacillus ferrooxidansATCC 23270 exposed to organic extractant-Lix984n.World Journal of Microbiology and Biotechnology, 2012, 28(3): 1045-1055.
(10) Xifen Zhu, Shaofu Deng,Yun Fang, Sen Yang, Yin Zhong, Dan Li, Heli Wang, Junhong Wu, and Ping’an Peng. Dehalococcoides-Containing Enrichment Cultures Transform Two Chlorinated Organophosphate Esters.Environmental Science & Technology. 2022, 56, 1951−1962.
(11) Yeshen Luo, Fei Liu, Enze Li,Yun Fang, Gang Zhao, Xin Dai, Jianjun Li, Bin Wang, Meiying Xu, Bing Liao, Guoping Sun. FRET-based fluorescent nanoprobe platform for sorting of active microorganisms by functional properties.Biosensors and Bioelectronics. 2020, 148: 111832.
(12) Xianqiang Li, Xin Jiang, Meiying Xu,Yun Fang, Yan Wang, Guoping Sun, and Jun Guo. Identification of stress-responsive transcription factors with protein-bound Escherichia coli genomic DNA libraries.AMB Express, 2020, 10: 1-14.
(13) Yingli Lian, Yonggang Yang, Jun Guo, Yan Wang, Xiaojing Li,Yun Fang, Lixia Gan, and Meiying Xu. Electron acceptor redox potential globally regulates transcriptomic profiling inShewanella decolorationisS12.Scientific Reports. 2016， 6(1): 1-9.
(14) Qihou Li, Nuo Li, Xueduan Liu, Zhijun Zhou, Qian Li,Yun Fang, Xiangru Fan, Xian Fu, Yi Liu, and Huaqun Yin, Characterization of the acid stress response of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270 based on the method of microarray.Journal of Biological Research. 2012. 17: 3-15.
代表性授权发明专利
李先强,姜昕,方云,许玫英.一种筛选鉴定胁迫应答基因表达调控因子的方法, 2020-7-20, 中国, CN202010699515.0
李先强,方云,姜昕,许玫英,郭俊.一类亚砷酸盐抑制因子报告基因质粒及其构建方法和应用, 2019-09-10, 中国,ZL201780001826.1
许玫英,周庆,方云,陈杏娟,孙国萍.一种利用零价铁强化偶氮染料生物降解的方法, 2015-6-24, 中国, ZL201310345316.X
许玫英,方云,陈杏娟,孙国萍.一种复合污染河流底泥微生物总DNA提取的前处理方法, 2015-4-22, 中国, ZL201310089141.0
